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T4DNA连接酶可以连接平末端，也可以连接粘性末端。
现在常用的DNA连接酶有T4DNA连接酶和大肠杆菌DNA连接酶。T4DNA连接酶可以连接平末端，也可以连接粘性末端，大肠杆菌DNA连接酶只能连接黏性末端。一般在实验中常用的连接酶是T4DNA连接酶。
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