独山子区地形呈斜条状,南北长,东西窄,西北高,东南低,绝大部分地区为戈壁滩,海拔在500米以下。平均海拔400米左右,最低点在艾里克湖,海拔250米左右。市区西部有加依尔山、青克斯山,北边有阿拉特山,中部、东部地形开阔平坦,向准噶尔盆地中心倾斜,南部独山子为山名,地处独山子区中西部,海拔为1283米。
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