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DNA变性后由于维持DNA二级结构的氢键断裂，由双链变为单链导致:
1、溶液粘度降低：双链结构分子量大且相互缠绕，流体阻力大,断裂成单链后阻力小，粘度变小。
2、溶液旋光性发生改变：变性后整个DNA分子的对称性及分子局部的构性改变，使DNA溶液的旋光性发生变化。
3、紫外吸收作用增强：由于双螺旋结构的破坏导致碱基的充分暴露，表现为OD260光吸收增大。
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