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一、树干上的不同
圆柏的直径大约可以达到3.5米，树皮的外表颜色比较深，为深灰色，从远处看外型上呈现出长尖塔形，枝条像不同的方向均匀的分布，小枝一般比较直立或者是稍微的形成弧状的弯曲。
侧柏的直径为1米左右，树皮比较薄，外表颜色为浅灰褐色，较浅一些，从远处看外型上呈现出圆锥的形状，小枝条比较的纤细，几乎向一个方向延伸，排成一个平面。
二、花朵上的不同
圆柏的雄花呈现椭圆形，长度大约2.5到3.5毫米左右，雄蕊一般为5到7对。
侧柏的雄花呈现卵圆形，长度大约为2毫米，雌花为近球形，直径大约2毫米，颜色为蓝绿色，上面覆盖着白粉。
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