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第一：这两者都可以用来消毒。但碘酊不能用在黏膜及破损的皮肤，且用后必须脱碘，如果是家常备用，选用碘伏比较安全。
第二：碘伏是属于广谱杀菌剂，碘酒则是可以治疗许多细菌性、真菌性、病毒性等皮肤病。碘伏可杀灭细菌繁殖体、芽孢、真菌、原虫和部分病毒。碘酒可以杀灭细菌、真菌、病毒、阿米巴原虫等。
第三：一般如果是冻伤，烧伤等可以用碘伏消毒。而一般情况下消毒则可以用碘酒。
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