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1、光学显微镜只能看到细胞和部分细胞器。如线粒体和叶绿体，但只能看到其存在，看不到细胞器的具体结构。
2、电子显微镜可以看到细胞器的精细结构，甚至可以看到病毒这种最小生物的结构，更甚至可以看到大分子。如蛋白质。
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